Kolagen adalah amfolit, yang bergantung pada dua faktor, pertama, kolagen memiliki banyak gugus samping asam atau basa per rantai peptida; kedua, setiap rantai peptida memiliki gugus -karboksil dan - Amino yang dapat menerima atau menyumbangkan proton, dan mereka dapat berdisosiasi dalam kisaran pH tertentu untuk menghasilkan muatan positif atau negatif. Dengan kata lain, dengan pH medium, kolagen yang berbeda menjadi bermuatan positif. atau ion bermuatan negatif. Nilai pKa kelompok samping rantai peptida kolagen sedikit berbeda dari kelompok samping asam amino penyusunnya, yang disebabkan oleh pengaruh muatan yang berdekatan dalam molekul protein. Titik isoelektriknya adalah 7,5~7,8, yang bersifat basa, karena ada lebih banyak asam amino basa daripada asam amino asam dalam rantai peptida kolagen. Karena merupakan polimer, ia memiliki sifat koloid dan viskositas tertentu dalam larutan berair. Viskositas terendah pada titik isoelektrik, dan semakin rendah suhu, semakin besar viskositas.
